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Un stromatolite ou stromatolithe est une construction calcaire marine, en eau peu profonde, de forme plus ou moins sphérique, due à des cyanobactéries. Leur activité encroûtante provoque la précipitation du calcaire en une succession de couches millimétriques, les lamines, qui se forment les unes au-dessus des autres. Les stromatolithes constituent les plus anciennes traces d’activité d’êtres vivants à la surface de la Terre. Certains stromatolithes fossiles datent de plus de 3,5 milliards d’années.
On pense que les cyanobactéries océaniques ont joué un rôle essentiel dans l'apparition de l'oxygène sur Terre, au tout début de l'apparition de la vie, entre -3500 MA et -2000 MA environ (Archéen).
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